পুকুরে ইলিশ বাঁচিয়ে রাখতে পারলেও এর বৃদ্ধি, স্বাদ ও বংশবিস্তার কোনোটিই নদীর মাছের মতো হয় না। মেঘনা নদী থেকে ধরা ইলিশের পোনা (জাটকা) ও কিশোর ইলিশ (টেম্পু) বিশেষ পদ্ধতিতে সংগ্রহ করে এসব পুকুরে ছাড়া হয়। কিন্তু প্রকল্প শুরুর এক বছরের মাথায় অধিকাংশ ইলিশ মারা যায়। এর একটাই কারন তা হলো পানি। কেননা ইলিশের জীবনচক্রে দুই ধরনের পানি দরকার, স্বাদু পানি ও লোনা পানি। কিন্ত পুকুরে কেবল স্বাদু পানি আছে, লবনাক্ত পানি নেই। তাই সম্ভব হয় না।