কূপ পবিত্র করার পাঁচটি পদ্ধতি রয়েছে। তথা:-
১/ যখন কূপে নাপাকি পড়ে যায়, তো সমস্ত পানি বের করার দ্বারা তা পাক হয়ে যাবে।
২/ যখন মানুষ, শূকর, কুকুর, বকরি, দুই বিড়াল অথবা এতটুকু বা এগুলোর চেয়ে বড় অন্য কোন জীব জন্তু কূপে পড়ে মরে যায়, তাহলে সমস্ত পানি বের করতে হবে।
৩/ যখন কোনো প্রবাহিত রক্ত বিশিষ্ট জীবজন্তু কূপে পড়ে (মরে গিয়ে) ফুলে গেছে অথবা ফেটে গেছে, তখন সমস্ত পানি বের করতে হবে। চাই ওই প্রাণীটি ছোট হোক বা বড় হোক।
৪/ যখন কবুতর, মুরগি, বিড়াল কিংবা এতোটুকুই বড় আকারের কোন প্রাণী পড়ে মরে যায় কিন্তু ফুলে নি, তখন ৪০ বালতি পানি বের করতে হবে।
৫/ আর যদি ইঁদুর, চড়ুই কিংবা এতোটুকুই বড় আকারের কোন প্রাণী পড়ে মরে যায়, তবে ২০ বালতি পানি বের করতে হবে। ২০ এর স্থলে ৩০ এবং ৪০ এর স্থলে ৬০ বালতি (পানি) বের করা মুস্তাহাব।