সিলিয়া এবং ফ্ল্যাজেলার মূল পার্থক্য হ'ল সিলিয়া হ'ল চুলের সাদৃশ্যযুক্ত একটি কোষে সংক্ষিপ্ত সংযোজন এবং ফ্ল্যাজেলাও চুলের মতো সংযোজন, তবে সেগুলি দীর্ঘ এবং খুব জটিল।
১.সিলিয়া হ'ল কোষের পৃষ্ঠ থেকে আউটগ্রোথের মতো খুব ছোট চুল এবং ফ্ল্যাজেলা কোষের পৃষ্ঠ থেকে আউটগ্রোথের মতো বড় চুল।
২.সিলিয়া একটি কোষে প্রচুর সংখ্যায় পাওয়া যায় এবং ফ্ল্যাজেলা সংখ্যায় কম পাওয়া যায়(10 এর কম)।
৩.সিলিয়া দুটি ধরনের, মোটাইল এবং ননমোটাইল এবং ফ্ল্যাজেলা তিন ধরনের, ব্যাকটেরিয়াম ফ্ল্যাজেলা, ইউক্যারিওটিক ফ্ল্যাজেলা এবং আর্কিয়েল ফ্ল্যাজেলা।
৪.সিলিয়া খুব দ্রুত নড়াচড়া সম্পাদন করে কিন্তু ফ্ল্যাজেলা ধীরে নড়াচড়া করে।
৫.সিলিয়া ইউক্যারিওটিক কোষে উপস্থিত থাকে কিন্তু ফ্ল্যাজেলা ইউক্যারিয়োটিক এবং প্রোক্যারিয়োটিক উভয় কোষেই উপস্থিত থাকে।